Simpleaffy包无法安装

Webb10 okt. 2016 · install.packages("simpleaffy") 报错package ‘simpleaffy’ is not available (for R version 3.3.1) 穿红衣的小红帽: 装更新版本的呗,去bioconducter 里面搜索,选最新 … WebbSimpleaffy is a BioConductor package that provides access to a variety of QC metrics for assessing the quality of RNA samples and of the intermediate stages of sample preparation and hybridization. Simpleaffy also offers fast implementations of popular algorithms for generating expression summaries and detection calls. © The Author 2005.

安装简单包时出现的问题 - 欧洲杯冠军投注

Webb17 okt. 2024 · R小白问题,有大神知道package was installed before R 4.0.0: please re-install it怎么解决吗,经管之家(原人大经济论坛) WebbAffymetrix芯片原始数据的R语言处理过程网络中很多,为什么我还要写?这要回归到自己做知乎的初衷:1.这是我对自己学习过程的一种总结方式;2.分享自己的所学给需要的各 … can people cough while sleeping https://shopcurvycollection.com

用affy包读取affymetix的基因表达芯片数据-CEL格式数据 生信菜 …

Webb8 nov. 2024 · Generate QC metrix for Affymetrix data. all.present: Filter by PMA call all.present.in.group: Filter by PMA call bg.correct.sa: Simpleaffy Implementation of Mas5 Background Correction call.exprs: Generate Expression Summaries for Affymetrix Data detection.p.val: Calculate Detection p-values get.annotation: Get annotation data for a … Webb8 sep. 2014 · 我尝试安装 package,使用 但收到警告 为什么 R 不认为 package 可用 另请参阅有关此问题的特定实例的这些问题: 我的 package 不适用于 R . . package Rbbg 不可 … WebbR> x.mas5@description@preprocessing qc returns an object containing scale-factors, % present, average, mininimum, max-imum and mean background intensities,and bioB, bioC, bioD and creX present calls can people cry money

谁能给我一下R语言里面的affy包,或者谁知道这个包跑到哪里去 …

Category:Bioconductor安装R包连接不上的问题 - 简书

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Simpleaffy包无法安装

基因芯片(Affymetrix)分析1:芯片质量分析 - hzs319 - 博客园

Webb5 aug. 2024 · 就是我的. "疫”外收获. 来源:人民日报新媒体. 最近看到人民日报新媒体公布的疫情相关的图特别漂亮,想着利用疫情的数据学着画一画,R语言爬虫弱爆的我,只能 … Webb9 okt. 2024 · 根据上述的这些标准,使用Bioconductor的simpleaffy包对Affymetrix芯片数据进行质量评估,最后得到质量控制总览图。 ## use simpleaffy package library (BiocInstaller) biocLite ("simpleaffy") library (simpleaffy) library (CLL) data (CLLbatch) # acquire analysis report Data.qc <- qc (CLLbatch) # visualize report plot (Data.qc) 上图显 …

Simpleaffy包无法安装

Did you know?

WebbWhen I load simpleaffy I am getting this error: Warning messages: 1: found methods to import for function as.list but not the generic itself 2: found methods to import for function eapply but not the generic itself > Also if I proceed with the processing, following the exact procedure in "QC and Affymetrix data", by Wilson et. al., (except … Webb26 sep. 2024 · 1. Rcmd INSTALL C:\Program Files\R\R-4.0.3\library\pbkrtest_0.4-7.tar.gz. 仍然报错,说程辑包无效,如下图所示,这就说明R的版本没有问题,肯定是没有找到 …

Webb7 maj 2024 · 在R studio中使用install.packages ('affy'),无法安装affy包,问题如下: > install.packages('affy') Warning in install.packages : package ‘affy’ is not available (for R … Webb28 aug. 2024 · I have installed simpleaffy package, then when I try to use it appears an error. library(simpleaffy) Loading required package: genefilter Error: package or …

Webb知乎,中文互联网高质量的问答社区和创作者聚集的原创内容平台,于 2011 年 1 月正式上线,以「让人们更好的分享知识、经验和见解,找到自己的解答」为品牌使命。知乎凭 … Webb3 使用 simpleaffy 包进行质量控制. simpleaffy整合了许多affy包常用的功能,剔除了不少基本用不着的功能,新增了质量控制的功能。. 这里只讲作质控图的流程。. 代码如下。. …

Webb13 juni 2024 · A tag already exists with the provided branch name. Many Git commands accept both tag and branch names, so creating this branch may cause unexpected …

Webb4 sep. 2013 · 基因芯片(Affymetrix)分析1:芯片质量分析. TAIR,NASCarray 和 EBI 都有一些公开的免费芯片数据可以下载。. 本专题使用的数据(Exp350)来自 NASCarray , … flame heater indoorWebb26 sep. 2024 · win+R或者输入cmd,切到R的安装目录x64下,即我输入命令: 1 cd C:\Program Files\R\R-4.0.3\bin\x64 进入到R的x64目录后,输入命令: 1 Rcmd INSTALL C:\Program Files\R\R-4.0.3\library\pbkrtest_0.4-7.tar.gz 仍然报错,说程辑包无效,如下图所示,这就说明R的版本没有问题,肯定是没有找到相关的内容,所以才无效。 方法3: … can people develop adhdWebb13 apr. 2024 · 解决方法: 将 install.packages ("simpleaffy") 改为如下代码, > source ("http://bioconductor.org/biocLite.R") Bioconductor version 3.3 (BiocInstaller 1.22.3), … can people cry in a comaWebb29 mars 2024 · 问题一:解决Rstudio中安装install.packages ("mvtnorm")出现 Warning in install.packages : InternetOpenUrl failed: '不能连接到吊销服务器,或者未能获得最终响应 … can people clone your cell phone numberWebb知乎,中文互联网高质量的问答社区和创作者聚集的原创内容平台,于 2011 年 1 月正式上线,以「让人们更好的分享知识、经验和见解,找到自己的解答」为品牌使命。知乎凭 … flame heater patioWebb5 feb. 2024 · 我想知道是否有人可以帮助我解决我在 install github 上遇到的问题。 无论我使用remotes::install github还是devtools::install github ,我都会收到以下错误消息,内容为 系统命令 Rcmd.exe 失败,退出状态: ,stdout stderr flame heated branding ironWebbBut I need to use another QC method from yaqcaffy package (spike controls for lys, phe, thr, dap) and it's not possible to change any file in yaqc library I think.? For another chip, U133A X3P I've not found any information about QC. I suppose this chip is very similar to hgu133plus2 chip but I'm not sure. flame heater outdoor